Состояние сохранности части саркофагов аварийное, многие разбиты, высока степень увлажнённости и засолённости известняка – материала саркофагов.
Реставрационные работы проводятся отделом монументальной скульптуры с 2001 г. и до настоящего времени, включают практически все консервационные мероприятия. Особую сложность представляет расчистка и склейка экспонатов (многие крышки саркофагов руинированы). Отреставрированы наиболее сильно разрушенные памятники, среди которых гробницы Евдокии Донской и Софии Палеолог.